Supercomputing for Molecular Dynamics Simulations

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ISBN/EAN: 9783319171487
This work presents modern implementations of relevant molecular dynamics algorithms using ls1 mardyn, a simulation program for engineering applications. The text focuses strictly on HPC-related aspects, covering implementation on HPC architectures, taking Intel Xeon and Intel Xeon Phi clusters as representatives of current platforms. The work describes distributed and shared-memory parallelization on these platforms, including load balancing, with a particular focus on the efficient implementation of the compute kernels. The text also discusses the software-architecture of the resulting code.
Autor: Alexander Heinecke, Wolfgang Eckhardt, Martin Horsch, Hans-Joachim Bungartz
EAN: 9783319171487
eBook Format: PDF
Sprache: Englisch
Produktart: eBook
Veröffentlichungsdatum: 30.03.2015
Untertitel: Handling Multi-Trillion Particles in Nanofluidics
Kategorie:
Schlagworte: Distributed and Shared-Memory Parallelization Fluid Dynamics High Performance Computing Molecular Dynamics Simulation Trillion Particles

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